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| Registros recuperados : 18 | |
| 11. |  | CASTRO, G. M. de; VILLANOVA, D. F. Q.; LIMA, J. C. F.; OTENIO, M. H.; CARNEIRO, J. da C. Aclimatação de Inóculo para determinação de PME. In: WORKSHOP DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA GADO DE LEITE, 17., 2016, Juiz de Fora. Anais... Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2016. 1 CD-ROM. (Embrapa Gado de Leite. Documentos, 186).| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 12. | | CASTRO, G. M. de; BOITEUX, L. S.; FONSECA, M. E. N.; LOBO, F.; RECH, E.; SILVA, F. R. da. Serendipitomics: a new virus found on an RNA-seq library. In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 22., 2014, San Diego, CA. [Abstracts]. San Diego: [s.n.], 2014. Não paginado. P018.| Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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| 13. | | GIACHETTO, P. F.; NHANI JUNIOR, A.; CASTRO, G. M. de; RODRIGUES, V. da S.; GARCIA, M. V.; BARROS, J. C.; ANDREOTTI, R. Differential gene expression in the cattle tick Rhipicephalus microplus fed on resistant and susceptible cattle. In: PLANT AND ANIMAL GENOME CONFERENCE, 27., 2019, San Diego. Abstracts... [S.l.: s.n.], 2019. Na publicação: Jacqueline Cavalcanti Barros, Renato Andreotti. PAG 2019. PE0246.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 14. | | CASTRO, G. M. de; BOITEUX, L. S.; FONSECA, M. E. de N. F.; LOBO, F.; RECH, E.; SILVA, F. R. da. Serendipitomics: a new virus found on an RNA-seq library. In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 22., 2014, San Diego, CA. [Abstracts]. San Diego: [s.n.], 2014. Não paginado. P018.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 15. | | CASTRO, G. M. de; BOITEUX, L. S.; FONSECA, M. E. de N. F.; LOBO, F.; RECH, E.; SILVA, F. R. da. Serendipitomics: a new virus found on an RNA-seq library. In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 22., 2014, San Diego, CA. [Abstracts...]. San Diego: [s.n.], 2014. Não paginado. P018.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 16. | | BELESINI, A. A.; CARVALHO, F. M. S.; TELLES, B. R.; CASTRO, G. M. de; GIACHETTO, P. F.; VANTINI, J. S.; CARLIN, S. D.; CAZETTA, J. O.; PINHEIRO, D. G.; FERRO, M. I. T. De novo transcriptome assembly of sugarcane leaves submitted to prolonged water-deficit stress. Genetics and Molecular Research, Ribeirão Preto, v. 16, n. 2, p. 1-20, 2017. Article gmr16028845.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 17. | | BELESINI, A. A.; TELLES, B. R.; CASTRO, G. M. de; GIACHETTO, P. F.; VANTINI, J. da S.; CARVALHO, F. M. de S.; CARLIN, S. R.; CAZETTA, J. O.; FERRO, M. I. T.; PINHEIRO, D. G. de novo assembly and transcriptome analysis of sugarcane leaves from contrasting varieties submited to prolonged water stress. In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 24., 2016, San Diego, CA. [Abstracts...]. San Diego: [s.n.], 2016. Não paginado. PAG 2016. Pôster P0792.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 18. | | TELLES, B. R.; CARVALHO, F. M. de S.; VANTINI, J. da S.; BELESINI, A. A.; CASTRO, G. M. de; GIACHETTO, P. F.; CARLIN, S. D.; SILVA, T. R. da; PINHEIRO, D. G.; CAZETTA, J. O.; FERRO, M. I. T. Prolonged water deficit reveals new profile of sugarcane gene expression and metabolic pathway related to tolerance. Sugar Tech, v. 21, n. 3, p. 451-461, May-June 2019.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| Registros recuperados : 18 | |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
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Data corrente: |
04/11/2015 |
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Data da última atualização: |
22/06/2016 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 1 |
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Autoria: |
HONGO, J. A.; CASTRO, G. M. de; CINTRA, L. C.; ZERLOTINI, A.; LOBO, F. P. |
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Afiliação: |
JORGE A. HONGO, Bolsista CNPTIA; GIOVANNI M. DE CASTRO, Bolsista CNPTIA; LEANDRO CARRIJO CINTRA, CNPTIA; ADHEMAR ZERLOTINI NETO, CNPTIA; FRANCISCO PEREIRA LOBO, CNPTIA. |
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Título: |
POTION: an end-to-end pipeline for positive Darwinian selection detection in genome-scale data through phylogenetic comparison of protein-coding genes. |
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Ano de publicação: |
2015 |
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Fonte/Imprenta: |
BMC Genomics, London, v. 16, p. 1-16, Aug. 2015. |
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DOI: |
10.1186/s12864-015-1765-0 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstract: Background: Detection of genes evolving under positive Darwinian evolution in genome-scale data is nowadays a prevailing strategy in comparative genomics studies to identify genes potentially involved in adaptation processes. Despite the large number of studies aiming to detect and contextualize such gene sets, there is virtually no software available to perform this task in a general, automatic, large-scale and reliable manner. This certainly occurs due to the computational challenges involved in this task, such as the appropriate modeling of data under analysis, the computation time to perform several of the required steps when dealing with genome-scale data and the highly error-prone nature of the sequence and alignment data structures needed for genome-wide positive selection detection. |
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Palavras-Chave: |
Comparative genomics; Evolução Darwiniana; Positive selection; Potion. |
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Thesagro: |
Fenótipo; Gene; Pesquisa. |
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Thesaurus NAL: |
Genes; Genome; Genomics; Phylogeny. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/132445/1/POTION.PDF
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Marc: |
LEADER 01725naa a2200313 a 4500
001 2027912
005 2016-06-22
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024 7 $a10.1186/s12864-015-1765-0$2DOI
100 1 $aHONGO, J. A.
245 $aPOTION$ban end-to-end pipeline for positive Darwinian selection detection in genome-scale data through phylogenetic comparison of protein-coding genes.$h[electronic resource]
260 $c2015
520 $aAbstract: Background: Detection of genes evolving under positive Darwinian evolution in genome-scale data is nowadays a prevailing strategy in comparative genomics studies to identify genes potentially involved in adaptation processes. Despite the large number of studies aiming to detect and contextualize such gene sets, there is virtually no software available to perform this task in a general, automatic, large-scale and reliable manner. This certainly occurs due to the computational challenges involved in this task, such as the appropriate modeling of data under analysis, the computation time to perform several of the required steps when dealing with genome-scale data and the highly error-prone nature of the sequence and alignment data structures needed for genome-wide positive selection detection.
650 $aGenes
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650 $aGene
650 $aPesquisa
653 $aComparative genomics
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700 1 $aLOBO, F. P.
773 $tBMC Genomics, London$gv. 16, p. 1-16, Aug. 2015.
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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